Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDRF1Q3B7T1 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms