Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 HHIPL2-201ENST00000343410 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 CYP1A2-201ENST00000343932 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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CNPY1Q3B7I2 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 SYBU-222ENST00000529175 2717 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 SMAP1-203ENST00000370455 3333 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AC005865.1-201ENST00000432994 3004 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 SPRY2-202ENST00000377104 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 ACOXL-202ENST00000389811 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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CNPY1Q3B7I2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 ZNF461-204ENST00000588268 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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CNPY1Q3B7I2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 CYP1A1-209ENST00000612821 2402 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 AC092902.5-201ENST00000641650 3256 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 NEK6-212ENST00000539416 2582 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CNPY1Q3B7I2 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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