Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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