Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NRF1Q16656 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms