Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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