Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ADGRE5-203ENST00000358600 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CYP1A1-209ENST00000612821 2402 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PLK4-210ENST00000514379 3060 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 NBPF1-204ENST00000432949 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ZNF572-201ENST00000319286 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 NUTM2B-202ENST00000372321 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 LINC01447-201ENST00000429010 2761 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SORBS2-203ENST00000319471 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ZNF839-209ENST00000559185 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ZNF300-203ENST00000418587 3226 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PAK1-202ENST00000356341 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CHTF8-201ENST00000306585 2561 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX1P83916 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 TUSC5-201ENST00000333813 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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