Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPL23P62829 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPL23P62829 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPL23P62829 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPL23P62829 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPL23P62829 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPL23P62829 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RPL23P62829 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms