Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP7P55210 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP7P55210 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP7P55210 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP7P55210 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP7P55210 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP7P55210 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP7P55210 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP7P55210 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP7P55210 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP7P55210 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP7P55210 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP7P55210 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP7P55210 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP7P55210 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP7P55210 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP7P55210 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP7P55210 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP7P55210 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP7P55210 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP7P55210 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms