Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNA2P51530 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNA2P51530 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNA2P51530 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNA2P51530 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNA2P51530 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNA2P51530 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNA2P51530 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms