Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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