Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD1P28340 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD1P28340 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD1P28340 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms