Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT1P21579 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT1P21579 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT1P21579 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT1P21579 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT1P21579 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT1P21579 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT1P21579 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms