Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms