Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms