Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms