Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms