Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC010547.1-202ENST00000567341 230 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms