Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TDGF1-205ENST00000542931 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC106733.1-201ENST00000624476 1038 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 C2-AS1-201ENST00000630806 762 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC006355.1-201ENST00000440982 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CARD8-214ENST00000520007 614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC015818.2-201ENST00000563569 840 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SUZ12P1-207ENST00000583950 741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC006557.1-201ENST00000591211 1085 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms