Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP2AP11388 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms