Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms