Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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