Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP83

COG5, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG5Q9UP83 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG5Q9UP83 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms