Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms