Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms