Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms