Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC092335.1-201ENST00000509037 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 SLC33A1-201ENST00000359479 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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