Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms