Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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GTF3C6Q969F1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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