Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms