Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms