Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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