Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms