Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ST3GAL6-202ENST00000394162 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SYTL2-206ENST00000389960 4299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AL590483.3-201ENST00000623669 3580 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TIAM2-201ENST00000275246 2491 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX1P83916 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX1P83916 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX1P83916 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX1P83916 NCBP2L-202ENST00000639756 1953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PCDHGA7-202ENST00000617050 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 FAM78A-202ENST00000372269 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 NEK6-212ENST00000539416 2582 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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