Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIRAP54198 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIRAP54198 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms