Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M2P53677 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms