Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNA2P51530 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNA2P51530 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNA2P51530 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNA2P51530 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNA2P51530 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNA2P51530 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNA2P51530 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNA2P51530 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNA2P51530 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNA2P51530 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNA2P51530 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNA2P51530 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms