Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMAN1P49257 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms