Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms