Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC073578.1-201ENST00000535133 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 RN7SL750P-201ENST00000582814 238 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 AL353997.3-201ENST00000586597 589 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRHP20396 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 MYL2-201ENST00000228841 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 SNAPC5-207ENST00000566658 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC021594.2-201ENST00000592499 527 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 MYO5BP1-201ENST00000610994 1239 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRHP20396 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRHP20396 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRHP20396 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRHP20396 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRHP20396 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRHP20396 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRHP20396 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TRHP20396 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRHP20396 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRHP20396 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 ANXA3-209ENST00000512884 1335 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 KCNK16-202ENST00000373229 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 AC007255.1-202ENST00000447171 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 AL132656.1-201ENST00000452173 490 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 AC097658.2-201ENST00000512715 624 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 OR7E126P-201ENST00000526217 888 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 TMEM253-206ENST00000556585 1236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 AP005203.1-202ENST00000584204 561 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRHP20396 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRHP20396 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRHP20396 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRHP20396 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRHP20396 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRHP20396 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRHP20396 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRHP20396 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRHP20396 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRHP20396 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRHP20396 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRHP20396 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRHP20396 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRHP20396 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms