Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GLI4P10075 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GLI4P10075 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GLI4P10075 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GLI4P10075 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GLI4P10075 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GLI4P10075 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GLI4P10075 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GLI4P10075 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GLI4P10075 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GLI4P10075 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GLI4P10075 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GLI4P10075 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms