Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms