Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN10AQ9Y5Y9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms