Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms