Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB4Q9Y5E5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms