Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDP1Q9Y5B0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDP1Q9Y5B0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDP1Q9Y5B0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDP1Q9Y5B0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDP1Q9Y5B0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDP1Q9Y5B0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDP1Q9Y5B0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDP1Q9Y5B0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDP1Q9Y5B0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDP1Q9Y5B0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDP1Q9Y5B0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDP1Q9Y5B0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDP1Q9Y5B0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTDP1Q9Y5B0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTDP1Q9Y5B0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms