Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms