Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9Y3F1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms