Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TPRKBQ9Y3C4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms