Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
REXO2Q9Y3B8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REXO2Q9Y3B8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REXO2Q9Y3B8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REXO2Q9Y3B8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REXO2Q9Y3B8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
REXO2Q9Y3B8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REXO2Q9Y3B8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms