Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SIK3Q9Y2K2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK3Q9Y2K2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms